土壤微生物在土壤物质转化中具有多种重要功能，不仅对土壤的发生、发育、土壤肥力的形成和植物营养元素的迁移转化起着重要作用，同时也对土壤中有机污染物以及农药的分解和净化、重金属和其他有毒元素的迁移转化起着不可忽视的作用。土壤酶主要由微生物、植物和动物的活体或残体构成，可催化土壤有机质的化学反应，因此在判断外来化学物质对土壤的污染程度及是否对生态环境造成影响时，常使用土壤微生物及土壤酶作为生态毒理指标。
在室内模拟条件下研究了敌草胺对土壤微生物种群数量及生物活性的影响，发现经敌草胺各浓度处理后，土壤细菌生长呈现抑制、恢复或激活的变化趋势，放线菌的生长则表现为先抑制后恢复的变化趋势，真菌生长则表现为在14 天前低浓度刺激，高浓度抑制，45 天后激活的变化趋势；设置室内培养试验测定除草剂草甘膦对土壤过氧化氢酶活性的影响时发现，草甘瞵抑制土壤过氧化氢酶活性，且随着浓度的升高，对过氧化氢酶活性抑制作用增强[7]。为更准确判断除草剂对土壤微生物及酶活性的影响，现已在分子水平进行研究。
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