医药中间体废水属水质比较复杂、高浓度、高色度、难降解的有机废水，针对医药中间体废水具有高COD、高盐度、高色度、成分复杂、可生化性差等特点，目前采用的处理方法一般是物化预处理+生化法组合处理。通过预处理的物化过程，使污染物浓度大幅度降低，减轻后续生物处理的负荷。
医药中间体废水物化预处理与生化法组合处理工艺
1、物化处理
由于医药中间体废水的水质特点使得多数制药废水单独采用生化法处理根本无法达标，所以在生化处理前必须进行必要的预处理。目前应用的物化处理方法主要包括混凝、气浮、吸附、氨吹脱、电解、离子交换和膜分离法等。根据医药废水的水质特点，在其处理过程中需要采用物化处理作为生化处理的预处理或后处理工序。预处理后的废水，可根据其水质特征选取某种厌氧和好氧工艺进行处理，若出水要求较高，好氧处理工艺后还需继续进行后处理。
2、生物处理
生化处理技术是目前制药废水广泛采用的处理技术，包括好氧生物法、厌氧生物法、好氧－厌氧等组合方法。
一般应设调节池，调节水质水量和pH，且根据实际情况采用某种物化或化学法作为预处理工序，以降低水中的SS、盐度及部分COD，减少废水中的生物抑制性物质，并提高废水的可降解性，以利于废水的后续生化处理。
具体工艺的选择应综合考虑废水的性质、工艺的处理效果、基建投资及运行维护等因素，针对不同废水采用不同预处理方法和生化系统的组合，通过预处理系统，减轻部分废水对微生物的抑制作用，另外提高废水的可生化性。
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