二甲酸钾由于其分子的特殊性，它在酸性状态下不解离，而在中性或者偏碱性的环境中才解离，释放出甲酸。大家都知道胃中的pH是相对较低的酸性环境，所以二甲酸钾能够85%通过胃进入肠道。当然如果食物的缓冲能力较强，也就是我们通常所说的系酸力较高的话，多的二甲酸钾会解离释放出甲酸而发挥酸化剂的效果，所以通过胃到达肠道的比例会有所降低。在这种情况下，二甲酸钾就是一个酸化剂！
当然，我们不希望所有的二甲酸钾都作为酸化剂来释放氢离子，而是希望它以多的完整分子态甲酸形式被释放，以保持它的杀菌能力。但这仅仅是我们的期望，也不一定符合动物生理的实际情况。因为所有通过胃进入十二指肠的酸性食糜都要经过胆汁和胰液的缓冲后进入到空肠才不至于引起空肠pH的巨大波动。这时候食糜的pH越低，通过十二指肠的速度越慢，同时也会刺激多的胆汁和胰液分泌，所以加有利于小肠中的消化吸收。在这个阶段又有部分二甲酸钾被当成酸化剂释放出氢离子。进入空肠和回肠的二甲酸钾逐步释放出甲酸，一部分甲酸还是释放出氢离子，还有部分完整的分子态甲酸则可以进入细菌体内去发挥抑菌作用。当达到回肠末端时，所剩的二甲酸钾比例已经不多了。有研究结果显示约14%左右的二甲酸钾会到达结肠。当然这个比例与食物的结构和动物的品种有关系。
到达大肠以后，二甲酸钾则可以多地发挥抑菌效果。为什么？因为正常情况下，大肠内的pH是相对酸性的。因为正常情况下，食物在小肠中被充分消化吸收，其中可消化的碳水化合物和蛋白都几乎被吸收完了，剩下些不能被消化的纤维类的东西进入到大肠。大肠中的微生物数量是小肠的10000倍，它们的作用的发酵那些剩下的纤维，而产生短链挥发性脂肪酸，如乙酸、丙酸和丁酸。所以，二甲酸钾在酸性环境下释放出来的甲酸则不易释放出氢离子，从而多地发挥抑菌效果。如果食物中有过量的蛋白，或者蛋白的可消化性并不强，那就会有过量的非消化蛋白进入大肠，其结果就是蛋白被腐败而产生碱性物质，如氨。这种非正常情况下，结肠的pH则是碱性的，许多疾病因此而起！ |
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