微波杀菌是微波的热效应和生物效应共同作用的结果。微波对细菌的热效应是使蛋白质变性，使细菌失去营养、繁殖和生存的条件而死亡；生物效应是微波电场改变细胞膜断面的电位分布，影响细胞周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细菌因此营养不良，不能正常新陈代谢，细菌结构功能紊乱，生长发育受到抑制而死亡。此外，决定细菌正常生长和稳定遗传繁殖的核酸（RNA）和脱氧核糖酸（DNA），是由若干氢键紧密连接而成的卷曲形大分子。足够强的微波场可以导致氢键松驰、断裂和重组，从而诱发遗传基因突变，或染色体畸变，甚至断裂。微波灭菌正是利用了电磁场的热效应和生物效应对生物的破坏作用，因此，微波杀菌温度低于常规方法，仅要70～105℃，时间约90～180s。
从图3可见，微波杀菌要有三个阶段，*一阶段是迅速升温，达到预定杀菌温度，此段宜用较强的均匀能量密度；第二阶段是保温过程，使杀菌物料的温度处于均衡的过程，第三阶段是自然或强制冷却过程。
2. 微波加热干燥、杀菌特点
2.1 加热迅速、均匀
不需热传导过程，它能在瞬间穿透到被加热物料中，穿透深度可达几厘米，甚至十几厘米，甚至十几厘米，数秒到数分钟就能把微波转换为热能。微波具有选择加热，将使加热更均匀。
2.2 节能高效 |
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